博物馆建筑面积为1171.01m2,内部分为五个展厅:序厅、温泉厅、清流人化石厅、丹霞厅、太极城厅、科普电影馆。

1)序厅

该厅面积为104.05m2,是对博物馆内容的总概括,对国家地质公园、福建清流温泉国家地质公园总的概括和介绍;同时电子触摸屏导览设备,为游客提供信息咨询、博物馆讲解员预定、免费发送科普读物和宣传册、导游租赁、游客休憩、免费饮用水等服务;是重要的人员集散和流通场地。

2)温泉厅

该厅面积为310m2,是博物馆的主体之一,主要介绍温泉的形成成因、分布、类型、功效等特征,重点介绍本公园内高赖、福田、月汤、塘州、邱元、内热汤等温泉地质遗迹的各项特征。


3清流人化石厅

该厅面积为151.03m2,是博物馆的主体之一,主要介绍古人类牙齿化石的发掘史、形态等特征,介绍古人类的生存环境等,介绍清流人化石的意义及影响。



4)丹霞厅

该厅面积为109.2m2,主要介绍公园内丹霞地貌的地质遗迹类型和特点、地质遗迹的成因、地貌的成因、自然景观等。


5)太极城厅

该厅面积为150m2,主要介绍清流县城的地质地貌形成过程、成因等特征,介绍清流的位置、人文、风土人情、自然风光等。


6)科普电影馆

该厅面积为201.6m2,分为三个部分,分别为电影馆100.6m2、科普长廊64m2、接待室37m2,其中科普电影馆设置多媒体放映系统一套。播放公园三维演示动画、科普宣传片,主要介绍公园的发展历史,充分展示公园的呈带状出露的高--低温温泉群、古人类化石遗址等特色地质遗迹景观的形成与演化,以及当地文化的多元性。